Dinas Perhubungan Kota Singkawang dibentuk sebagai bagian dari perangkat daerah Kota Singkawang sesuai dengan Peraturan Daerah Nomor 3 Tahun 2016 tentang Pembentukan dan Susunan Perangkat Daerah, kemudian mengalami penyesuaian dalam Peraturan Wali Kota Nomor 65 Tahun 2016, dan diperbarui melalui Peraturan Wali Kota Nomor 13 Tahun 2021 untuk menyelaraskan tugas, fungsi, serta struktur organisasinya dengan peraturan perundang-undangan yang berlaku.

Dinas Lingkungan Hidup Kota Singkawang pertama kali dibentuk berdasarkan Peraturan Daerah Kota Singkawang Nomor 3 Tahun 2016 tentang Pembentukan dan Susunan Perangkat Daerah. Kemudian, kedudukan, susunan organisasi, tugas, dan fungsinya ditetapkan lebih lanjut melalui Peraturan Wali Kota Singkawang Nomor 11 Tahun 2021, yang kemudian digantikan oleh Peraturan Wali Kota Nomor 71 Tahun 2021. Untuk menyesuaikan dengan kebijakan penyederhanaan birokrasi dan penyetaraan jabatan administrasi ke jabatan fungsional, aturan tersebut mengalami perubahan dengan diterbitkannya Peraturan Wali Kota Nomor 112 Tahun 2021. Dengan demikian, Dinas Lingkungan Hidup Kota Singkawang secara resmi telah beroperasi sejak tahun 2016, dengan beberapa perubahan dalam struktur dan fungsinya hingga tahun 2021.

Dinas Pendidikan dan Kebudayaan Kota Singkawang resmi dibentuk pada tahun 2016 berdasarkan Peraturan Wali Kota Nomor 56 Tahun 2016 sebagai unsur pelaksana urusan pemerintahan daerah di bidang pendidikan dan kebudayaan, kemudian disesuaikan dengan Peraturan Wali Kota Nomor 5 Tahun 2021 untuk menyelaraskan kedudukan, struktur organisasi, tugas, dan fungsi dinas sesuai dengan peraturan terbaru.

Dinas Pekerjaan Umum dan Penataan Ruang Kota Singkawang dibentuk berdasarkan Peraturan Wali Kota Nomor 66 Tahun 2021, yang kemudian mengalami perubahan melalui Peraturan Wali Kota Nomor 107 Tahun 2021 pada 2 Desember 2021, dengan tujuan mengatur kedudukan, susunan organisasi, tugas, fungsi, serta tata kerja dinas dalam mendukung pembangunan infrastruktur dan penataan ruang di Kota Singkawang.